Sus principales áreas de investigación son:

• Biotecnología de microalgas
• Cultivos microalgales y limitaciones nutricionales
• Precipitación de carbonato inducida microbiológicamente mediante procesos fotosintéticos (MICP fotosintético)
• Biosorción y remoción de metales pesados

Proyectos

1. Proyecto CORFO 25CVC 302526 - Phytoria. Proyecto de innovación y desarrollo tecnológico asociado a Phytoria, relacionado con tecnologías biológicas y desarrollo de soluciones aplicadas a bioestimulación y agricultura. Ejecución: no especificada en la información proporcionada. Proyecto CORFO 24IRV 271784 - Hydractive. Proyecto de innovación tecnológica asociado a Hydractive. 
2. FONDEF Idea I+D D18i10364 - ANID. Producción de ácido araquidónico mediante metabolismo heterotrófico y mixotrófico en microalgas.
3. CORFO 19SN-112449. Sistema de detección temprana de floraciones algales nocivas mediante fluorescencia UV.
4. FONDECYT Postdoctorado N.º 3230210 - ANID. “Nitrogen limitation as a culture strategy for increasing heavy metal removal in wastewaters through photosynthetic MICP”. Ejecución 2023-2026. Investigador postdoctoral.
5. CORFO 19SN-112456. Producción de microalgas enriquecidas con ácidos grasos poliinsaturados.
6. Contrato Tecnológico CORFO. Extracción de polifenoles del vino mediante tecnologías de adsorción en resinas. Ejecución 2018-2020.
7. Proyecto CORFO Voucher 2017. Desarrollo de snacks basados en legumbres. Ejecución 2017. 
8. CORFO Voucher 16VIP-58534. “Evaluación de una solución de control para la proliferación de microalgas en la industria salmonera”. 
9. Proyecto Gobierno Regional de Tarapacá. Tratamiento de aguas contaminadas con arsénico y boro para riego agrícola. Ejecución 2016.
10. CORFO Innova Chile - I+D Aplicada Línea 2. Desarrollo tecnológico de cultivo de microalgas para el abatimiento de metales pesados en agua dulce. Ejecución: no especificada en la información proporcionada.
11. Proyecto PPS - Proteína de Plasma de Salmón, CORFO Innova Chile. Proyecto de I+D para valorización de subproductos de la industria salmonera mediante procesos destinados a recuperar componentes proteicos conservando su calidad nutricional. 
12. Proyecto privado Phytoria / Genera SpA. Desarrollo de tecnología de bioaumentación customizada de fertilizantes biológicos. Ejecución 2017-2023.

 Publicaciones (2022 - Actualidad)

1. Cosenza, B.; Allodi, R.; Usai, L.; Minardi, R.; Cosenza, A.; Soto-Ramírez, R.; Concas, A.; Lutzu, G. A. Advanced feature engineering and Gradient Boosting optimization for predicting Limnospira platensis growth dynamics under mixotrophic conditions using agro-industrial byproducts. Algal Research (2026). DOI: 10.1016/j.algal.2025.104445.
2. Franzoso, L.; Usai, L.; Allodi, R.; Fais, G.; Dessì, D.; Soto-Ramírez, R.; Cosenza, B.; Damergi, A.; Lutzu, G. A.; Concas, A. Mixotrophic cultivation of Limnospira (Spirulina) platensis using early-stage fig processing wastewater: Effects on biomass composition, antioxidants and phycocyanin. Marine Drugs (2026). DOI: 10.3390/md24050163.
3. Cosenza, B.; Kusianovich, A.; Lutzu, G. A.; et al., including Soto-Ramírez, R. Regime-aware unsupervised monitoring of microalgal photobioreactors via change-point detection and ensemble anomaly scoring. (2026). Trabajo indicado en el CV como artículo en publicación.
4. San Martín, J.; Kusianovich, A.; Soto-Ramírez, R.; Rivas, M.; Jeison, D.; Torres-Aravena, Á. Photosynthetically driven carbonate precipitation by Chlorella vulgaris controls copper immobilization under non-equilibrium conditions. Algal Research (2026).
5. Cosenza, B.; Minardi, R.; Usai, L.; et al., including Soto-Ramírez, R. Data-Driven Ensemble Machine Learning for Multi-Horizon Microalgal Bioprocess Forecasting. Processes (2026).
6. Soto-Ramírez, R.; Barrientos-Lobos, N.; Videla, S.; Chamy, R. Improving irrigation water quality using a pilot algal treatment system: A case study from northern Chile. Case Studies in Chemical and Environmental Engineering (2025), 12, 101281. DOI: 10.1016/j.cscee.2025.101281.
7. Contreras, P.; Oviedo, C.; Soto-Ramírez, R.; Vásquez-Sandoval, C.; Navarrete, J.; Dantagnan, P. Impacts of conventional and industrial wastewaters-based media on biomass production, nutrient dynamics, and fatty acid profile in a thraustochytrid culture. Preparative Biochemistry & Biotechnology (2025).
8. Soto-Ramírez, R.; et al. Engineering the cell wall reactive groups of plant growth promoting rhizobacteria by culture strategy for heavy metal removal. Journal of Biotechnology (2024).
9. Díaz-Navarrete, P.; Dantagnan, P.; Henríquez, D.; Soto-Ramírez, R.; Correa-Galeote, D.; Sáez-Arteaga, A. Selenized non-Saccharomyces yeasts and their potential use in fish feed. Fish Physiology and Biochemistry (2024). DOI: 10.1007/s10695-024-01340-7.
10. Soto-Ramírez, R.; Tavernini, L.; Lobos, M.-G.; Poirrier, P.; Chamy, R. Thermodynamic and kinetic insights into the adsorption mechanism of Cd(II) using Chlorella vulgaris cells with coverage modified by culture media engineering. Algal Research (2023). DOI: 10.1016/j.algal.2023.103179.